Libros de C++ y recursos online hay infinitos. Lo que en este post traslado es sólo mi experiencia sobre una serie muy limitada de recursos bibliográficos y/o electrónicos que a mí personalmente me han sido, y siguen siendo, de gran utilidad en mi desempeño profesional. Algunas de mis recomendaciones pueden ser discutibles dado que a día de hoy cualquier persona interesada dispone de ingente cantidad de información vía blogs, manuales online, foros, etc., etc. Pero, ya digo, es mi experiencia y, en mi opinión, algunos buenos libros, cuando se hace el esfuerzo de consultarlos con detenimiento, siguen conteniendo información que a menudo es difícil, sino prácticamente imposible, encontrar online.
Antes de mencionar cualquier material o recurso vale la pena dedicar unas líneas al entorno de desarrollo a utilizar (IDE, por sus siglas en inglés). En mi caso, por diversas circunstancias, he tenido que programar bajo sistemas Windows, Mac y Linux. Por ello se que, un paso importante a la hora de disponer de un método de trabajo eficiente es encontrar un entorno que nos permita generar no sólo código portable sino proyectos de desarrollo intercambiables entre los diferentes sistemas operativos. Hoy día hay herramientas gratuitas y muy potentes, como pueden ser NetBeans y Eclipse, pero personalmente mis preferencias se inclinan, en el caso de C++, por Code::Blocks el cual puede integrarse con diferentes compiladores y que se distribuye gratuitamente bajo licencia GPL v3.0 l. Lo podemos bajar con el compilador GCC ya incluido por defecto. Esta última opción en el caso de Windows implica la instalación (la hace Code::Blocks de manera automática) de MinGW (Minimalist GNU for Windows) es decir, el sistema GNU (sistema operativo tipo-Unix pero libre) mínimo para poder trabajar bajo Windows. MinGW incorpora la colección de compiladores GNU que son más conocidos bajo el acrónimo GCC (GNU Compiler Collection) incluyendo los compiladores de C, C++, ADA y Fortran. Utilizando Code::Blocks, el que esto escribe, ha compilado y ejecutado sin problemas y sin cambiar ni un punto y coma, el mismo proyecto bajo Windows, Linux y Mac. Es cierto que para proyectos de gran complejidad y posiblemente enfocados a sistemas operativos concretos, puede haber otros IDEs más completos y potentes. Sin embargo, para el desarrollo de proyectos de mediana complejidad en biología computacional me parece que Code::Blocks supone un compromiso más que correcto entre facilidad de configuración y optimización, manejo y eficiencia.
Recursos online
Hay infinidad de manuales disponibles gratuitamente online. Para comprobarlo basta teclear en vuestro buscador favorito (no os voy a engañar, el mío es google): "c++ pdf" y obtendréis inmediatamente un listado de manuales en el formato indicado que podréis bajar sin ningún problema a vuestro ordenador. Pero aparte de todos esos pdfs, si disponemos de una conexión a internet, podemos acceder una serie de páginas que dan información y ejemplos rápidamente.
1.- Aquí se puede ver por encima la estructura de la Biblioteca Estándar de C++
http://es.wikipedia.org/wiki/Biblioteca_est%C3%A1ndar_de_C%2B%2B
2.- La siguiente NO es la mejor referencia de C++
http://www.cplusplus.com/reference/
Pues ha sido criticada por contener algunas inexactitudes conceptuales o código no eficiente en algunos de sus ejemplos pero, sin embargo, es una página útil para consulta rápida de métodos asociados a contenedores como vector o métodos de string o algoritmos. Es ligera y carga relativamente rápido. Útil si deseamos obtener información concreta sobre algunas clases de la biblioteca. En mi caso suelo hacer consultas rápidas sobre, por ejemplo, vector:
http://www.cplusplus.com/reference/vector/vector/
3.- El mítico stackoverflow
http://stackoverflow.com/questions/tagged/c%2B%2B
En realidad cuando busco una forma eficiente, o simplemente una forma, de hacer algo, lo que hago es "googlear" el término de búsqueda junto al término c++ y de la lista de resultados consulto en primer lugar los de stackoverflow. Por ejemplo si googleamos: median c++
http://stackoverflow.com/questions/2114797/compute-median-of-values-stored-in-vector-c
4.- El curso de C++ de Zator Systems
http://www.zator.com/Cpp/index.htm
Es un curso con algunos muy buenos ejemplos y explicaciones. Su resumen de operadores de C++ está en mi pestaña de favoritos.
Libros
1.- C++ básico. Autora: Carmen Fernández. Ed. Starbook (http://www.starbook.es/libros/C-BASICO/2245/978-84-936896-8-1)
En mi caso este es un descubrimiento reciente y es el libro que recomiendo actualmente para comenzar en C++ (no en C) desde 0. Tiene, a mi modo de ver, dos ventajas importantes: la primera, es que es un manual breve, sencillo y directo (de muy buen precio) y la segunda es que, a diferencia de muchos otros libros y manuales, menciona dos elementos fundamentales de la Librería Estándar de C++, como son las clases string y vector. Ambas clases facilitan inmensamente la vida del programador con respecto a las herramientas de funcionalidad similar disponibles en C. Otro aspecto interesante de este libro es que los ejemplos del mismo han sido desarrollados utilizando Code::Blocks de modo que dedica un par de páginas a presentar el IDE, explicar cómo se crea un proyecto etc.
2.- Programación en C/C++. Guias prácticas de Anaya multimedia
¿Quién no ha consultado alguna vez en sus inicios alguna de estas guías? Suelen ser manuales de bajo coste, cómodos y útiles para consultas rápidas.
3.- Enciclopedia del lenguaje C++ (C++ estándar). Autor: Fco. Javier Ceballos. Ed. Ra-Ma
Este autor es muy prolífico y tiene varios libros sobre C++ y en otros lenguajes. A mí me gusta este en particular. Es un libro muy completo (y "gordo" 1000 páginas), muy bien explicado y con buenos ejemplos.
4-. Numerical recipes in C++. The Art of Scientific Computing. Autores: Press et al. Ed. Cambridge University Press
Que yo sepa, no hay traducción al español. La edición en inglés que tengo es la del 2002 en su reimpresión de 2005. En cualquier caso, lo digo así de claro, este libro es una de mis biblias. Ello, a pesar de ser consciente de que ha sido bastante criticado, tanto por su pobre diseño desde el punto de vista de la programación orientada a objetos (es poco más que una traducción de C a C++ aprovechando las ventajas de la librería estándar), como desde el campo de la computación numérica, por presentar varios algoritmos que distan de ser los más eficientes en el estado actual del arte de algunos de los muchos campos que toca. Sin embargo, este es un riesgo a asumir, al menos en mi opinión, ante una obra enciclopédica que, en apenas 1000 páginas, introduce conceptos, explica brevemente los métodos y muestra el código completo en C++ de algoritmos que abarcan cuestiones tan dispares, a la par que útiles, como pueden ser la descomposición de Cholesky de una matriz cuadrada (no os riais que sí que sí que es muy útil, cualquiera que haya tenido que generar series de variables correlacionadas lo sabe), la generación de números aleatorios, ordenación, autocorrelación, momentos de una distribución, cálculo de probabilidades de una Chi cuadrado, la tansformada de Fourier, etc, etc. Es un libro que siempre tengo a mano, a partir del cual he programado infinidad de funciones para calcular probabilidades, medias, varianzas, covarianzas... En otras ocasiones me ha servido como una guía de información rápida sobre determinados conceptos y métodos. Una obra de consulta fundamental.
5.- The C++ Standard Library. A Tutorial and Reference. Autor: Nicolai Josuttis. Ed. Addison-Wesley 2012
Este no es un libro para aprender C++ ni algoritmos numéricos. Como su nombre indica es un tutorial y una referencia sobre la Librería Estándar de C++. Personalmente, la mayoría de mis consultas sobre la Librería Estándar las hago utilizando los recursos online, pero este libro incluye algunas explicaciones sobre determinadas características y ventajas de la librería que es difícil (aunque supongo que no imposible) encontrar online. Es un libro claro y profundo, con explicaciones muy buenas, por ejemplo, sobre las ventajas e inconvenientes de los distintos tipos de contenedores (arrays, deques, lists, vectors...), las nuevas características del nuevo estándar C++11 (incluyendo la nueva y magnífica librería de números aleatorios), la biblioteca de algoritmos, etc. Una obra magistral indicada para aquellos que ya saben programar en C++ y desean sacarle todo el partido a la librería estándar.
Y por ahora esto es todo. Hay, por supuesto, muchos más libros y recursos. Pero, como ya dije, estos me parecen útiles para biólogos computacionales o al menos lo han sido en mi caso, a la hora de programar modelos de simulación, algoritmos genéticos y métodos de contraste estadístico en C++. Otros libros de referencia, más avanzados, que quedan lejos (o muy lejos) de la intención de este post y que por tanto sólo me limito a mencionar serían:
Programming. Principles and Practice Using C++ (Stroustrup)
C++ Templates. The Complete Guide (Vandermonde & Josuttis)
Exceptional C++ (Herb Sutter)
Modern C++ Design (Alexandrescu) (muy lejos)
